O Fundo Setorial de Saúde criado em 2001 é um novo instrumento para o fomento da pesquisa na área da saúde. O histórico e os principais desafios do Fundo são descritos. São listados os principais projetos financiados no período de 2002-2007, mostrando-se a evolução orçamentária do Fundo no período de 2002-2006. As estratégias de definição das prioridades são descritas, em particular o I Seminário do Fundo Setorial de Saúde. A atual composição do Comitê Gestor é apresentada.
Palavras-chave: pesquisa em saúde, gestão de pesquisa, financiamento à pesquisa, prioridades de pesquisa.