A Faculdade de Medicina da Bahia (FAMEB) é a mais antiga do país, criada em 18 de fevereiro de 1808, e teve um grande papel na formação de pessoal e produção científica ao longo de sua história. O presente artigo busca avaliar a produção científica da FAMEB em período recente. Para tanto, a sua produção científica é cotejada com a da Universidade Federal da Bahia (UFBA), com base nos dados da Web of Sciences da Thomson Scientific no período de 1998 a 2007. A FAMEB, uma das 30 Unidades da UFBA, e com 10% dos seus professores, é responsável por cerca de 25% dos artigos da UFBA indexados internacionalmente. Ademais, entre os 10 artigos da UFBA mais citados neste período, cinco possuem autores da FAMEB. A análise da produção da FAMEB demonstra que a Imunologia, a Medicina Tropical, a Saúde Pública, Ambiental e Ocupacional, as Doenças Infecciosas, seguidas de Psiquiatria, Neurologia, Microbiologia, Farmacologia e Endocrinologia são as áreas com maior produtividade. Entre as dez revistas com maior número de publicações indexadas da FAMEB, cinco são nacionais e cinco internacionais. Estudo recente da Academia Brasileira de Ciências também coloca a FAMEB entre as escolas médicas brasileiras com maior produção científica. Em conjunto, os dados demonstram que a FAMEB continua bastante ativa como pólo gerador nas ciências médicas ao comemorar o seu bicentenário.
Palavras-chave: Medicina, produção científica, ciências médicas.